＞また、面倒であれば私が不動産会社との間に入ってやりとりする提案はしていきますが、一括借り上げでうまく回る可能性がある以上、それを思いとどまらせる説得をどのように進めるか悩んでいます。

お金より自由な時間が欲しいということだと思いますので、説得は難しいと思います。時間はお金では買えません。手数料は5%でも10%でもよく、すこしでも手間を減らしたいということでしょう。相談者さんに依頼したほうが、サブリースより手間が減らせるということがあれば可能性はあるかもしれません。

＞また、土地を担保に融資を受けて、手残り2%以下なのは普通ですか？
2%の計算方法や融資条件など諸条件が分からないので何とも言えませんが、投資家目線だと少ないと感じます。

投資家ならもっと建築費を下げて収益性を上げます。
しかしご自宅を建てられるのでしたら、お金をかけてでも理想的な自宅を建てるという選択肢もあると思います。目的次第だと思います。地主で不動産や税金の知識がおありとのことなので、その中でのご判断ならよいのかなと思います。